隐藏动物是疯狂动物园中需要通过完成特定操作才能触发的稀有物种，玩家必须满足各种前置条件才能使它们现身，这些条件通常涉及连续骑乘、奔跑距离、换乘不同动物或完成随机任务等。抓捕隐藏动物不仅能丰富动物园的收藏，还能提升游客吸引力和游戏收益，因此掌握正确的触发方法是成功的关键。玩家需要耐心尝试不同的策略，并注意游戏机制的变化，以增加遇到这些稀有生物的机会。
草原地图的隐藏动物包括暗黑野牛，它要求玩家骑乘同一只野牛连续奔跑800米；特洛伊斑马则需要连续换乘七种不同的草原动物才能出现；油炸狮的触发条件是用同一只狮子连续吃掉30个动物，中途复活不会重置计数；机械秃鹰在玩家奔跑至1400米后出现在中间的大石头上，需借助长颈鹿或大象狂暴状态将其甩上去抓捕。骷髅象和鸵鸟老板等隐藏动物主要通过随机BOSS任务获得，而流行秃鹰可通过频繁换乘秃鹰提高出现概率。
丛林地图的隐藏动物有鸭嘴河马，它可以通过骑同一只河马奔跑1600米或撞击15个动物来触发，建议在2000米后水塘密集区域尝试；恐龙犀牛要求连续换乘七种不同的丛林动物；三嘴鸟则需骑乘巨嘴鸟起跳100米并安全换乘，最佳时机是在暴走状态上升到最高点时起跳。雄鸡鳄用鳄鱼连续吃动物时可能出现，且在清晨时段刷新概率较高，而异形虎需要老虎连续吃掉30个动物才能解锁。
山脉地图的隐藏动物包括苏-24战斗熊，它要求骑同一只老鹰飞行2000米；罗宾汉鹰需沿跑道边缘的灌木丛方向飞出至最远的山峰上；纯黑鹿则要连续换乘八种动物，其中七种为山脉动物加一种外来动物。蒸汽朋克隐藏动物可通过骑乘牦牛撞飞10个动物触发，中途复活不会重置计数。这些动物的出现往往依赖精准的操作和地形利用，玩家需提前规划路线以优化抓捕效率。
其他地图如澳洲、极地和侏罗纪公园也拥有独特的隐藏动物，澳洲的变色骆驼需连续换乘八种动物，包括七种澳洲动物和一种外来动物；极地的仙女企鹅要求连续换乘八种极地动物加一种外来动物，机械狐狸需骑同一只狐狸跑1500米，雪兔要连续换乘六只北极兔；侏罗纪公园的海怪甲龙需用甲龙撞倒霸王龙随机出现，健身霸王龙通过收集五个恐龙蛋触发，潜水雷龙在连续骑乘八种动物后可能现身。
玩家可以通过升级动物区域等级来解锁部分隐藏动物，例如极地区域升至7级可解锁隐形企鹅，热带雨林区域9级会解锁丛林蜥蜴。关注游戏中的天气变化也很重要，因为雪豹只在下雪天出现，电鳗则在雷雨天气更易触发。每日登录签到和完成特定任务如连续跳跃或累积奔跑距离也能增加隐藏动物的出现机会，而一些动物只能通过内购或随机BOSS任务获得，建议玩家优先尝试免费方法，将内购作为备选方案。
